Przejmą one sprawy, które już są w SN, a także te, w których wyznaczono rozprawę lub posiedzenie przed wejściem w życie ustawy. W uproszczonej strukturze zbyteczne będzie Kolegium SN, którego obowiązki wykona pierwszy prezes SN.
W pierwszej instancji w sprawach dyscyplinarnych sędziów mają orzekać sądy dyscyplinarne przy nowych sądach regionalnych, a w sprawach prokuratorów Sąd Dyscyplinarny przy prokuratorze generalnym. SN będzie sądem dyscyplinarnym drugiej instancji. Jako sąd dyscyplinarny pierwszej instancji będzie właściwy w sprawach umyślnych przestępstw ściganych z oskarżenia publicznego lub umyślnych przestępstw skarbowych. Zajmie się też sprawami dyscyplinarnymi sędziów SN.