W ramach ryczałtu od dochodów spółek (estońskiego CIT) opodatkowaniu nie podlega roczny dochód spółki, lecz zysk netto przeznaczony do wypłaty wspólnikom lub na pokrycie strat z okresu poprzedzającego opodatkowania ryczałtem. Jeżeli więc wspólnicy decydują się na zatrzymanie zysku w spółce, to nie będzie ona odprowadzała od niego CIT.
Przedmiotem opodatkowania ryczałtem jest jednak nie tylko podzielony zysk. Niektóre rozliczenia wspólników ze spółkami mogą skutkować opodatkowaniem. Podatek wystąpi z tytułu wypłaty ukrytych zysków lub gdy spółka poniesie wydatki niezwiązane z działalnością gospodarczą. Wspólnicy powinni zatem zaplanować swoje transakcje ze spółką w taki sposób, aby nie wiązały się one z niekorzystnymi skutkami podatkowymi.