Sprawa dotyczy spółki zajmującej się produkcją węgla koksowego i koksu. Jest ona podatnikiem podatku od nieruchomości, VAT, podatku od czynności cywilnoprawnych (PCC), CIT i płatnikiem PIT. Spółka zobowiązana jest też na podstawie prawa geologicznego i górniczego do uiszczenia opłaty eksploatacyjnej.
Spółka zapłaciła podatek od nieruchomości w wysokości wyższej niż należna. Planowała więc wystąpić do właściwego organu podatkowego (w przypadku podatku od nieruchomości jest nim wójt, burmistrz lub prezydent miasta) z wnioskiem o zaliczenie nadpłaty na poczet innych zobowiązań podatkowych powstałych z tytułu VAT, PCC, CIT, PIT i opłaty eksploatacyjnej.