W efekcie zatem powinna być stosowana stawka VAT właściwa w momencie wystawienia faktury, jednocześnie bez konieczności skorygowania kwoty VAT w 2011 r. o różnicę wynikającą z zastosowania stawki nowej i starej. Wydaje się jednak, że organy podatkowe mogą kwestionować takie stanowisko i zobowiązać do podwyższenia kwoty VAT należnego w 2011 r.
W podobnej sytuacji dotyczącej dostawy tzw. mediów (usługi telekomunikacyjne, energia elektryczna, gaz, ścieki etc.) przepisy przejściowe przewidują, że gdy zostanie wystawiona faktura w 2010 r., która obejmuje okresy rozliczeniowe z 2011 r., korekta VAT (o różnicę między zastosowaniem stawki starej a nowej) będzie mogła nastąpić w pierwszej „zwykłej” fakturze wystawianej w 2011 r., nie później niż w ciągu sześciu miesięcy od dnia zmiany stawki podatku, tj. do końca czerwca 2011 r. Trzeba jednak pamiętać, że przy dostawie „mediów” samo wystawienie faktury nie powoduje powstania obowiązku podatkowego (który rozpoznawany jest w terminie płatności), stąd korekta jest konieczna.
Analogicznie obowiązek skorygowania 1 proc. podatku pojawi się przy usługach najmu, dzierżawy, leasingu, usługach transportowych, jeśli faktura zostanie wystawiona w 2010 r., a wykonanie usługi i płatność nastąpią w 2011 r. Dla tych czynności również wystawienie faktury nie skutkuje powstaniem obowiązku podatkowego. Jednak tutaj ustawodawca nie przewidział przepisów przejściowych, zatem konieczne będzie wystawienie faktury korygującej.
W przepisach przejściowych wyłączono stosowanie opisanych powyżej zasad w razie nabycia towarów z UE lub spoza UE. Oznacza to, że w przypadku wewnątrzwspólnotowego nabycia oraz importu towarów stosowana będzie stawka VAT właściwa w dniu powstania obowiązku podatkowego (odpowiednio co do zasady z dnia wystawienia faktury i powstania długu celnego).
Należy zauważyć, że przepisy przejściowe nie odnoszą się do importu usług, a wynika to stąd, że w tym wypadku zasadniczo obowiązek podatkowy przypada w dniu wykonania usługi.