Wydatki na nabycie uprawnień do emisji CO₂ mogą stanowić zarówno bezpośrednie, jak i pośrednie koszty podatkowe. O ich kwalifikacji podatkowej decyduje charakter oraz główny przedmiot działalności nabywającego je podmiotu.
„Wynagrodzenie za bezumowne korzystanie” czy „odszkodowanie”? Na gruncie VAT rozróżnienie to jest kluczowe, bo tylko wynagrodzenie za świadczenie usług podlega opodatkowaniu. Odszkodowanie co do zasady pozostaje poza zakresem tego podatku.