Biegły sądowy jest organem pomocniczym wymiaru sprawiedliwości w tych wszystkich przypadkach, gdy od sądu wymagane są wiadomości specjalne. Naczelny Sąd Administracyjny stwierdził, że tytułu biegłego można używać tylko wtedy, gdy sporządza się opinie dla uprawnionego podmiotu; używanie go w innych przypadkach jest niedopuszczalne (wyrok z 12 kwietnia 1999 r., II SA 336/99).
Decydując się na skorzystanie z wiedzy biegłego, sąd wydaje postanowienie o dopuszczeniu dowodu z jego opinii. Jednocześnie określa, jakie czynności wymagają specjalistycznej wiedzy. Wskazuje też na przedmiot i zakres opinii. Mimo to nie ma wpływu na jej merytoryczną treść. Dostarczona przez biegłego opinia jest – zdaniem Sądu Najwyższego (wyrok z 6 lutego 2003 r., IV CKN 1763/00) – w toku prowadzonego postępowania jednym z wielu środków dowodowych, podlegającym ocenie sądu. Zatem osoba powołana na biegłego teoretycznie jest samodzielna w swoich działaniach. Nie do końca jednak.
Opodatkowana VAT jest odpłatna dostawa towarów i odpłatne świadczenie usług na terytorium kraju (art. 5 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT). Przez odpłatne świadczenie usług rozumiemy każde świadczenie na rzecz osoby fizycznej, osoby prawnej lub jednostki organizacyjnej niemającej osobowości prawnej, które nie stanowi odpłatnej dostawy towarów na terytorium kraju, w tym również świadczenie usług zgodnie z nakazem organu władzy publicznej lub podmiotu działającego w jego imieniu bądź nakazem wynikającym z mocy prawa (art. 8 ust. 1 pkt 3 ustawy o VAT).
Ustalenie, że mamy do czynienia z dostawą towarów albo świadczeniem usług, nie oznacza jednak, że od razu trzeba płacić VAT. Opodatkowane są bowiem tylko te czynności, które zostały wykonane przez podmiot mający cechę podatnika. Art. 15 ust. 1 ustawy o VAT mówi, że podatnikiem jest każda osoba prawna, jednostka organizacyjna niemającą osobowości prawnej oraz osoba fizyczna, wykonująca samodzielnie działalność gospodarczą, bez względu na cel lub rezultat takiej działalności. Działalność gospodarcza obejmuje z kolei wszelką działalność producentów, handlowców lub usługodawców, w tym podmiotów pozyskujących zasoby naturalne oraz rolników, a także działalność osób wykonujących wolne zawody, również wówczas, gdy czynność została wykonana jednorazowo w okolicznościach wskazujących na zamiar jej wykonywania w sposób częstotliwy. Tak pojmowana działalność gospodarcza obejmuje również czynności polegające na wykorzystywaniu towarów lub wartości niematerialnych i prawnych w sposób ciągły dla celów zarobkowych.
Przy takich założeniach sprawę opodatkowania usług świadczonych przez biegłych sądowych na zlecenie sądów i innych organów należałoby uznać za zamkniętą, gdyby nie art. 15 ust. 3 pkt 3 ustawy o VAT. Przepis ten mówi, że za wykonywaną samodzielnie działalność gospodarczą nie uznaje się czynności, z tytułu których przychody zostały wymienione w art. 13 pkt 2 – 9 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych (ustawa o PIT), jeżeli z tytułu ich wykonania osoby te są związane ze zlecającym ich wykonanie prawnymi więzami tworzącymi stosunek prawny między zlecającym wykonanie czynności i wykonującym zlecane czynności co do: