Jeśli podatnik nie skorzysta z tej możliwości, kontrolerzy samodzielnie mogą wystąpić do urzędu statystycznego o wydanie stosownej interpretacji. Nawet zakładając brak złej woli po stronie organów podatkowych, w wielu przypadkach stany faktyczne przedstawiane w takich wnioskach odbiegają od rzeczywistości (chociażby z tego powodu, że kontrolerzy nie mają specjalistycznej wiedzy na temat procesów technologicznych dotyczących konkretnych towarów). Może to niewątpliwie wpłynąć na interpretację organów statystycznych.
Od interpretacji statystycznej można się odwołać. Jednak podobnie jak przy wnioskach o interpretację, tak i przy odwołaniach nie jest to postępowanie sformalizowane. W razie otrzymania interpretacji niezgodnej z poglądem wnioskodawcy należy przede wszystkim dokładnie przeanalizować stan faktyczny. Mogło się bowiem zdarzyć, że jeden element uwypuklony we wniosku (a niekoniecznie istotny w rzeczywistości) przesądził o takiej, a nie innej klasyfikacji.
Ponadto warto porównać różne interpretacje otrzymane na przestrzeni lat. Dany produkt lub działalność, która była przedmiotem niepoprawnej, zdaniem wnioskodawcy, opinii mogła być już przedmiotem interpretacji według innej klasyfikacji, np. PCN, SWW itp. Stosując klucze powiązań pomiędzy klasyfikacjami, łatwiej jest wskazać błędy w otrzymanej opinii.
Jak podkreślił Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 25 czerwca 2003 r. (ISA/Ka1419/02): "Podatnik nie może ponosić z datą wsteczną negatywnych konsekwencji zmiany stanowiska organów statystycznych co do klasyfikacji sprzedawanych towarów". Jeśli więc podatnik dysponuje przychylną interpretacją, to może na jej podstawie podejmować decyzje podatkowe. Nie jest to jednak zakres ochrony tak skuteczny, jak w wypadku wiążących interpretacji podatkowych. Wskazywał na to np. NSA w wyroku z 6 listopada 2002 r. (ISA/Gd1979/01), w którym czytamy: "W sytuacji, gdy ujawniają się sprzeczne opinie klasyfikacyjne różnych urzędów statystycznych co do takiego samego towaru, rzeczą organów jest wyjaśnienie takich rozbieżności i zwrócenie się do centralnego organu administracji rządowej o wyjaśnienie tych rozbieżności. Błędy urzędników nie prowadzą do nabycia prawa nieprzewidzianego ustawowo i nie zmuszają organów do powielania tych błędów wtoku kolejnych czynności. Zgodnie z art. 14 § 6 ordynacji podatkowej jedynie zastosowanie się przez podatnika do urzędowej interpretacji prawa podatkowego nie może mu szkodzić".
Ważny dla praktyki stosowania klasyfikacji statystycznych jest również wyrok NSA z 5 czerwca 2003 r. (III SA 2214/01), który stwierdza: "zagadnieniem o charakterze ogólnym, które rzutuje także na ocenę niniejszej sprawy, jest problematyka związana ze sposobem traktowania przez organy podatkowe opinii klasyfikacyjnych organów (jednostek) statystyki. Otóż na tym tle zarysowały się dwa stanowiska w orzecznictwie sądu administracyjnego, a mianowicie stanowisko wyłączności organów statystycznych i stanowisko, iż opinie i interpretacje z zakresu klasyfikacji statystycznych są w postępowaniu administracyjnym dowodem, który powinien odpowiadać warunkom z art. 180 ordynacji podatkowej (art. 75 k.p.a.) i który podlega ocenie organu stosującego prawo. Sąd w składzie orzekającym w niniejszej sprawie podziela pogląd wyrażony jako drugi, tj. uważa, że stanowisko organów statystyki publicznej ma charakter opinii podlegających ocenie organów podatkowych". Autor jest doradcą podatkowym