Podatnikiem VAT nie tyle się „jest", co raczej się „bywa". Opodatkowaniu VAT podlegają bowiem czynności wykonywane przez podatnika tego podatku, działającego w takim charakterze. Jednak ustalenie, kiedy warunki te są spełnione może sprawiać trudności, co potwierdzają niedawne rozstrzygnięcia organów podatkowych i sądów administracyjnych w zakresie opodatkowania VAT czynności wykonywanych w ramach kontraktu menedżerskiego.
W orzeczeniu z 22 lutego 2017 r. (I FSK 1014/15) Naczelny Sąd Administracyjny oddalił skargę kasacyjną spółki, której kontrola podatkowa zakwestionowała prawo do odliczenia naliczonego VAT z faktur dotyczących usług menedżerskich. Spór dotyczył rozliczeń pomiędzy spółką a jej menedżerem – prezesem zarządu, który prowadzi działalność gospodarczą w zakresie świadczenia usług menedżerskich i zarządzania. Usługi wykonywane przez prezesa na rzecz spółki zostały zdefiniowane w umowie menedżerskiej. Zgodnie z jej treścią, do obowiązków prezesa należało m.in. przygotowanie i wdrażanie strategii, realizowanie celów, priorytetów oraz procedur związanych z działalnością gospodarczą spółki, wdrażanie procedur i praktyk związanych z zakupami, reprezentowanie spółki w kontaktach z klientami i kontrahentami, wprowadzanie w życie uchwał podejmowanych przez radę nadzorczą i zgromadzenie wspólników, wykonywanie innych funkcji administracyjnych niezbędnych do zarządzania spółką. Spółka natomiast zobowiązała się do zapłaty wynagrodzenia prezesa, zapewnienia mu samochodu służbowego oraz pokrywania kosztów jego utrzymania, zwrotu kosztów związanych z przejazdem i zakwaterowaniem poniesionych przy pełnieniu obowiązków służbowych.