Jednym z największych wyzwań przedsiębiorców decydujących się na restrukturyzację jest odzyskanie płynności finansowej. Trudno jednak mówić o realnej szansie na poprawę sytuacji ekonomicznej, jeżeli już na początku postępowania na dłużnika nakładane są dodatkowe obciążenia podatkowe wynikające z jego wcześniejszych problemów finansowych.
Takim właśnie obciążeniem jest obowiązek skorygowania podatku naliczonego w ramach ulgi na złe długi. Choć rozwiązanie to ma swoje uzasadnienie w systemie podatku od towarów i usług, to jego stosowanie wobec przedsiębiorców objętych restrukturyzacją budzi coraz więcej wątpliwości. W praktyce prowadzi bowiem do sytuacji, w której przedsiębiorca, który nie może regulować zobowiązań objętych układem, zostaje zobowiązany do zapłaty dodatkowego podatku wynikającego właśnie z faktu ich nieuregulowania.