Podatnicy nie są zobligowani do wykorzystania wyłącznie wymienionych w przepisach metod. W przypadku, gdy nie jest możliwe lub odpowiednie zastosowanie żadnej z nich, w celu weryfikacji rynkowości realizowanych rozliczeń, podatnik może wybrać inną metodę, najbardziej odpowiednią w danych okolicznościach. Przykładem mogą być tutaj techniki wyceny.
Warto o tym pamiętać, szczególnie gdy podmiot przygotowuje wyceny – na przykład w celach rachunkowych. Po dokładnej weryfikacji może okazać się, że sporządzona wycena będzie również przydatna w kontekście obowiązków związanych z cenami transferowymi. Pozwoli to uniknąć podatnikowi poniesienia podwójnych kosztów związanych z przygotowywaniem dwóch odrębnych dokumentów.