We wniosku o interpretację spółka wyjaśniła, że posiada zakłady (oddziały) położone na obszarze gminy innej, niż właściwa dla jej siedziby. Oświadczyła, że od co najmniej pięciu lat nie składała informacji CIT-ST i CIT-ST/A, ponieważ, w jej ocenie, nie była do tego zobowiązana. Tłumaczyła, że przez cały ten okres nie uzyskiwała dochodu (ani w skali miesiąca, ani w skali roku). Miała stratę. Firma zatrudnia pracowników, którzy w umowach o pracę mają określone miejsce świadczenia pracy inne, niż siedziba pracodawcy. Spółka wskazała, że jej zakłady (oddziały) nie są wyodrębnione organizacyjnie z jej struktury: nie posiadają odrębnego budżetu ani zorganizowania na zasadach ustalonych w regulacjach wewnętrznych tych jednostek. Poprosiła o potwierdzenie, że podatnik, który nie uzyskuje dochodu, nie jest zobowiązany do składania informacji CIT-ST oraz CIT-ST/A.
Fiskus nie zgodził się z takim stanowiskiem. Stwierdził, że o istnieniu zakładu (oddziału) w rozumieniu art. 28 ust. 1 ustawy o CIT, a w konsekwencji o konieczności składania informacji CIT-ST, decyduje określone w umowie o pracę miejsce świadczenia pracy przez pracownika. Przepisy nie pozwalają na uznanie, że ponoszenie przez spółkę straty zwalniało ją z obowiązku składania informacji CIT-ST.
Spór trafił na wokandę, ale Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie oddalił skargę spółki. W jego ocenie, wykładnia językowa spornego przepisu prowadzi do wniosku, że objęci są nim wszyscy ci podatnicy, którzy posiadają zakłady (oddziały) położone na obszarze jednostki samorządu terytorialnego innej niż właściwa dla siedziby podatnika. Podkreślił, że przepis ten nie ustanawia w tym zakresie żadnego wyjątku.
Tak samo uznał Naczelny Sąd Administracyjny. Zgodził się z WSA, że art. 28 ust. 1 ustawy o CIT nie przewiduje wyjątku od reguły składania informacji CIT-ST. Wykładnia językowa uzupełniona wykładnią celowościową oraz systemową zewnętrzną pozwala na stwierdzenie, że wyłączną przesłanką powstania obowiązku złożenia informacji CIT-ST przez podatnika jest posiadanie zakładu (oddziału) na terenie innej jednostki samorządu terytorialnego, niż właściwa dla jego siedziby.
W ocenie NSA wniosek spółki, że ponoszenie przez podatnika straty, tak miesięcznie, jak i w skali roku, zwalnia podatnika z obowiązku składania informacji, jest zbyt daleko idący i nie znajduje potwierdzenia w przepisach. Ani w ustawie o CIT, ani w ustawie o dochodach jednostek samorządu terytorialnego nie ma regulacji wskazujących, że obowiązek sporządzenia i złożenia informacji CIT-ST, jest uwarunkowany jakimkolwiek innym kryterium niż posiadanie przez podatnika zakładu (oddziału).