W kwietniu 2014 r. spółka wystąpiła o interpretację w zakresie CIT. Wskazała, że jest podatnikiem CIT o nieograniczonym obowiązku podatkowym w Polsce. Jest także akcjonariuszem w spółce komandytowo-akcyjnej (SKA), która nie jest podatnikiem CIT. Przed zakończeniem obecnego roku obrotowego planowane jest przekształcenie w spółkę jawną, w związku z którym nie dojdzie do żadnych wypłat. Spółka zapytała czy planowane przekształcenie w spółkę jawną będzie się dla niej wiązało z powstaniem jakiegokolwiek przychodu (dochodu) podlegającego CIT.
Spółka wskazała, że w toku przekształcenia nie dochodzi do likwidacji spółki przekształcanej, a jedynie do zmiany jej formy prawnej. Przekształcenie zachodzi na zasadzie kontynuacji tożsamości prawnej spółki przekształcanej i przekształconej. Jako przyszły wspólnik spółki jawnej powstałej z przekształcenia, nie osiągnie ona przychodu (dochodu). W ocenie podatniczki przepisy ustawy o CIT nie przewidują bowiem, aby tego rodzaju przychód podlegał opodatkowaniu.
Innego zdania był jednak fiskus. Zauważył, że w stanie prawnym obowiązującym przed 1 stycznia 2014 r., spółka komandytowo-akcyjna nie była podatnikiem podatku dochodowego. Podatnikami byli wspólnicy tych spółek. Od 1 stycznia 2014 r. spółki komandytowo-akcyjne stały się natomiast podatnikami CIT. Na podstawie art. 4 ust. 1 ustawy zmieniającej, objęcie zakresem ustawy spółek komandytowo-akcyjnych, których rok obrotowy nie zakończył się 31 grudnia 2013 r., zostało przesunięte. Ustawa o CIT w nowym brzmieniu ma do nich zastosowanie począwszy od pierwszego dnia roku obrotowego tej spółki, rozpoczynającego się po 31 grudnia 2013 r. W ocenie urzędników, z zastrzeżenia zawartego w art. 4 ust. 1 ustawy zmieniającej wynika, że w przypadkach wymienionych w art. 6 ust. 1 tej ustawy, które będą miały miejsce po 31 grudnia 2013 r., zastosowanie znajdują przepisy o CIT w brzmieniu obowiązującym od 1 stycznia 2014 r. Fiskus uznał, że w sprawie znajdzie zastosowanie art. 6 ust. 1 pkt 4 ustawy zmieniającej, co oznacza, że wartość niepodzielonych zysków będzie przychodem wnioskodawczyni.
Spółka zaskarżyła interpretację i wygrała. Stanowiska fiskusa nie zaakceptował bowiem ani Wojewódzki Sąd Administracyjny w Poznaniu, ani Naczelny Sąd Administracyjny.
Sąd kasacyjny zauważył, że art. 4 ust. 1 ustawy zmieniającej w przypadku spółki komandytowo-akcyjnej zasadniczo stosuje się począwszy od pierwszego dnia roku obrotowego tej spółki, rozpoczynającego się po 31 grudnia 2013 r. Zwrócił też uwagę na treść przepisu przejściowego, tj. art. 6 ust. 1 pkt 4 ustawy zmieniającej.