Naczelny Sąd Administracyjny oddalił skargę kasacyjną podatniczki, której fiskus zarzucił błędne rozliczenie VAT (sygnatura akt: I FSK 452/12).
Sąd kasacyjny uznał, że złożenie korekty deklaracji jest prawem podatnika i nie ma charakteru bezwzględnie wiążącego.
Problemy skarżącej zaczęły się po tym, jak urzędnicy postanowili skontrolować jej rozliczenia z budżetem za 2007 r. m.in. z tytułu VAT. Ze względu na regulacje dotyczące limitów trwania kontroli u przedsiębiorców fiskus musiał zakończyć swoje działania po dwóch miesiącach. Kontrola wykazała stosunkowo niewielką nieprawidłowość, która została uwidoczniona w protokole. Kobieta go nie kwestionowała i na podstawie nieprawidłowości wykazanej w protokole kontroli skorygowała stosowane deklaracje VAT.
Postępowanie podatkowe trwało jednak dalej. A po sprawdzeniu jednego z kontrahentów podatniczki na jaw wyszły kolejne nadużycia. Okazało się bowiem, że firma, z którą współpracowała skarżąca, wystawiała tzw. puste faktury. Taki dokument nie daje prawa do odliczenia VAT. To z kolei oznaczało, że rozliczenie firmy podatniczki było błędne. W konsekwencji organy wydały decyzję z prawidłowym określeniem zobowiązania podatkowego.
Podatniczka nie zgadzała się z tym rozstrzygnięciem. Zarzuciła m.in., że po doręczeniu protokołu z kontroli była ona kontynuowana. A takie postępowanie jest niedopuszczalne.
Organ odwoławczy odpierał ten zarzut. Wyjaśnił, że zakończenie kontroli podatkowej miało związek z nowelizacją ustawy o swobodzie działalności gospodarczej oraz o zmianie innych ustaw. Nic nie stało na przeszkodzie, aby po przedłużeniu kontroli i wskazaniu nowego terminu załatwienia sprawy kontynuować postępowanie.
Spór trafił na wokandę, ale podatniczka przegrała. Najpierw rację fiskusowi przyznał Wojewódzki Sąd Administracyjny w Olsztynie. Uznał, że postępowanie kontrolne nie kończy się wraz z podpisaniem i doręczeniem stronie protokołu z kontroli.
Prawo do wydania decyzji potwierdził też NSA. Jak wyjaśnił sędzia NSA Artur Mudrecki, korekta skarżącej dokonana na podstawie protokołu kontroli nie stanowiła przeszkody do określenia zobowiązania w należytej wysokości. Liczy się prawda materialna. W związku z tym, jeśli po doręczeniu protokołu i dokonaniu korekty przez podatnika nadal toczy się postępowanie, to fiskus ma prawo zweryfikować rozliczenie podatnika. I to zarówno w sytuacji, gdy jest to dla niego korzystne, jak i niekorzystne. Wyrok jest prawomocny.