JPK_VAT okazał się sporą rewolucją dla podatników i od początku wywoływał wiele wątpliwości. Ministerstwo Finansów dostrzegło problem i przygotowało propozycję zmian w raportowaniu JPK_VAT, czyli ewidencji połączonej z deklaracją.
Jedna ze zmian ma ułatwić życie podatnikom stosującym metodę podzielonej płatności, tzw. MPP. Ma polegać na tym, że oznaczenie „MPP" będzie dotyczyć wszystkich transakcji objętych mechanizmem podzielonej płatności, nie tylko – jak to jest obecnie – obowiązkiem jej stosowania. Jak wskazano w uzasadnieniu projektu, obowiązek wykazania w JPK_VAT będzie odnosił się do przypadków, w których MPP stosowany jest również dobrowolnie. W ocenie ekspertów wywoła to jednak więcej zamieszania, a rozliczeń nie ułatwi.