Przy obliczaniu dochodu będącego podstawą opodatkowania w PIT i CIT można uwzględnić wszelkie koszty uzyskania przychodu, z wyjątkiem wyraźnie wymienionych w ustawie, jako niepodlegające potrąceniu. Przy czym – zgodnie z ustawową definicją – kosztem uzyskania przychodu jest taki wydatek, który został poniesiony w celu osiągnięcia przychodów lub zachowania albo zarachowania źródła przychodów. Do takich wydatków należą również płacone przez przedsiębiorcę podatki i inne daniny publicznoprawne – oczywiście tylko te, które mają związek z prowadzoną przez niego działalnością gospodarczą.
[srodtytul]PCC, akcyza i opłata targowa[/srodtytul]
Jeśli chodzi o podatki, będą to: podatek od czynności cywilnoprawnych (PCC), od nieruchomości, od środków transportu. Do kosztów zaliczymy także: opłatę targową i opłatę skarbową.
Najczęściej są one kosztem bezpośrednim, ale też może być tak, że zwiększają wartość początkową składnika majątku trwałego: środka trwałego lub wartości niematerialnej i prawnej (tak jest np. z PCC naliczonym przy ich nabyciu) i stają się kosztem uzyskania w postaci odpisów amortyzacyjnych. Z tym że gdy zwiększą wartość początkową środka trwałego niepodlegającego amortyzacji (np. gruntu), będą mogły być zaliczone do kosztów podatkowych dopiero w momencie jego zbycia.
Kosztem uzyskania jest też podatek akcyzowy, z tym że na mocy art. 23 ust. 1 pkt 44 ustawy o PIT i art. 16 ust. 1 pkt 47 ustawy o CIT została z takich kosztów wyłączona akcyza od nadmiernych ubytków i zawinionych niedoborów wyrobów akcyzowych.