Ministerstwo Finansów dość dobitnie dawało do zrozumienia w trakcie prac legislacyjnych, że zmiany w opodatkowaniu spółek komandytowych są podyktowane wchodzeniem przez nie w różne struktury z innymi podmiotami, w tym z osobami prawnymi, by omijać podatki. Dlatego, przynajmniej dla celów podatkowych, nadano im status podobny do osób prawnych, np. spółek z o.o. Nie zdecydowano się jednak na zmiany w prawie cywilnym i prawie spółek, które nadałyby spółce komandytowej autentyczną osobowość prawną. Spółki takie będą zatem jedynie „ułomnymi" osobami prawnymi, co ma skutki podatkowe dla wspólników.

Oczywiście spółka komandytowa wciąż będzie służyła do prowadzenia biznesu. Jednak zyski wspólnika z takiej spółki nie będą traktowane jak zyski z działalności gospodarczej. Zmieniono ich kwalifikację: będą to zyski z udziału w osobie prawnej (choć oczywiście spółka komandytowa taką osobą nie będzie).

Czytaj także: Zmiany podatkowe dla spółek 2021

Skutek: jeśli ktoś oprócz udziału w spółce komandytowej prowadzi też np. indywidualną działalność gospodarczą, nie będzie mógł łączyć przychodów i kosztów z tej działalności z przychodami i kosztami spółki komandytowej. Ten dodatkowy biznes trzeba będzie zatem rozliczać oddzielnie. Ma to znaczenie, gdy np. dotychczas jedna osoba kompensowała sobie zyski i straty z różnych rodzajów działalności.

Spółka komandytowa nie będzie mogła tworzyć podatkowych grup kapitałowych – ani tych oficjalnych, ani nieformalnych. Te pierwsze, zdefiniowane w art. 1a ustawy o CIT, są zastrzeżone dla podatników będących osobami prawnymi (prawdziwymi). Istota tych drugich polega na tym, że jedna osoba może być wspólnikiem w wielu spółkach komandytowych lub komandytowych i innych spółkach osobowych (jawnej lub partnerskiej). Dotychczas taki wspólnik mógł łączyć „wyniki" takich spółek komandytowych i płacił podatek od łącznego dochodu przez nie wygenerowanego, z uwzględnieniem strat.

Takie rozwiązanie jest dziś całkowicie legalne. Nie będzie jednak możliwe w związku z tym, że przychody i koszty w każdej ze spółek będą rozliczane osobno na potrzeby ustalenia CIT.