Niestety, wszystko wskazuje na to, że mamy do czynienia z importem usług naliczanym od kwoty brutto.
Być może pracownik Państwa spółki, dokonując zakupu, skorzystał z prywatnego konta i w tym konkretnym przypadku wybrał opcję „wystaw fakturę na inny podmiot” (czyli na spółkę). Dodatkowo, na fakturze dostawca usługi (zakładamy, że jest to usługa elektroniczna albo o charakterze podobnym do licencji uprawniającej do korzystania z określonej aplikacji/funkcji) posłużył się numerem VAT-EU, który to numer jest wykorzystywany w rozliczeniach z tzw. konsumentami (Państwa firma nie jest konsumentem, a podmiotem prowadzącym działalność gospodarczą).