Tak orzekł Wojewódzki Sąd Administracyjny ?w Warszawie w wyroku z 4 grudnia 2013 r. (III SA/Wa 1369/13).
Spółka będąca podmiotem prawa zagranicznego złożyła wniosek o zwrot podatku. Organ podatkowy wezwał podatnika o jego uzupełnienie poprzez dostarczenie oryginałów faktur lub faktur, na których kwota podatku wyrażona będzie w złotych. Spółka uzupełniła wskazane braki formalne wniosku, jednak uchybiła wyznaczonemu na to terminowi. Organ przywrócił termin do uzupełnienia braków, a następnie zwrócił należny podatek. Uznał jednak, że oprocentowanie z tytułu opóźnionego zwrotu VAT należy liczyć po upływie 6 miesięcy od daty uzupełnienia wniosku.
Zdaniem spółki odsetki powinny być kalkulowane zgodnie z terminem liczonym od dnia złożenia wniosku o zwrot podatku. W ocenie podatnika, biorąc pod uwagę ?art. 139 § 4 ordynacji podatkowej (dalej: o.p.), możliwe jest jedynie zawieszenie biegu terminu na czas oczekiwania przez organ na uzupełnienie braków formalnych. Spółka twierdziła, że wniosek wraz z wymaganymi przez ustawę załącznikami został dostarczony w terminie, a jedynie zawierał braki formalne.
W ocenie organu 6-miesięczny termin należy liczyć od daty, kiedy podatnik złożył wniosek wraz z kompletem dokumentów potrzebnych do rozpatrzenia sprawy, zgodnie z art. 7 ust. 4 VIII Dyrektywy. Wezwanie do uzupełnienia braków stanowi – zdaniem organu – przerwanie biegu terminu. Dlatego prawidłowy termin liczenia odsetek następuje od dnia następnego po upływie 6-miesięcznego terminu na zwrot podatku, liczony od dnia dostarczenia organowi wszelkich niezbędnych dokumentów wymaganych do rozpatrzenia wniosku.
Sąd podzielił stanowisko organu podatkowego. Wskazał, że powoływanie się przez skarżącego na art. 139 § 4 o.p., przewidujący zawieszenie biegu terminu na czas oczekiwania przez organ na uzupełnienie wniosku, nie może mieć tutaj zastosowania, gdyż przepis Dyrektywy ma charakter przepisu procesowego. ?VIII Dyrektywa znajduje tu zastosowanie, wyraźnie wskazuje bowiem na 6-miesięczny termin od dnia złożenia wniosku wraz ?z wszystkimi załącznikami.