Zgodnie z ogólnymi zasadami wynikającymi z ustawy o VAT podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia VAT wynikającego z faktur dokumentujących nabycie towarów lub usług. Warunkiem jest jednak, aby zakup ten był związany z wykonywaną przez podatnika działalnością opodatkowaną.
Należy jednak pamiętać, że faktura wadliwa nie uprawnia do odliczenia wynikającego z niej podatku naliczonego. Nabywca, który otrzyma taki dokument i na jego postawie dokona pomniejszenia kwoty podatku należnego, ryzykuje, że organy podatkowe zakwestionują jego rozliczenia podatkowe. Oznacza to, że [b]faktury zakupu otrzymywane przez podatnika przed ich zaksięgowaniem i uwzględnieniem w rozliczeniach VAT powinny podlegać weryfikacji co do ich poprawności.[/b] Przypadki uznania faktury za wadliwą zostały wymienione w art. 88 ust. 3a ustawy o VAT.
[srodtytul]1. Sprzedaż udokumentowana fakturami wystawionymi przez podmiot nieistniejący lub nieuprawniony do wystawiania [/srodtytul]
Z sytuacją taką będziemy mieli do czynienia w razie fałszywych faktur wystawionych przez podmioty, które w ogóle nie istnieją. W celu uniknięcie takiego ryzyka przed nawiązaniem współpracy z danym podmiotem warto uzyskać potwierdzenie jego rejestracji w ewidencji działalności gospodarczej lub w Krajowym Rejestrze Sądowym.
Organy podatkowe kwestionują również faktury VAT wystawione przez podmioty, które nie dopełniły obowiązku zarejestrowania się jako podatnicy VAT czynni. Stanowisko takie jest jednak coraz częściej kwestionowane przez sądy administracyjne. Przykładowo[b] WSA w Warszawie w wyroku z 29 maja 2007 r[/b]. uznał, że „odwołując się ponownie do orzecznictwa ETS, można również stwierdzić, iż status podatnika jest kategorią niezależną od rejestracji. Podmioty wykonujące określone w tym przepisie czynności, we wskazanych warunkach, stają się podatnikami podatku od wartości dodanej bez względu na dopełnienie warunków formalnych związanych z rejestracją”.