[b]Potwierdził to WSA w Warszawie w wyroku z 21 października 2008 r. (III SA/Wa 1098/08).[/b]
Organy podatkowe zakwestionowały prawo spółki do odliczenia podatku naliczonego. Uznały bowiem, że faktury pochodzą od podmiotu, który nie był czynnym podatnikiem VAT.
Na podstawie art. 88 ust. 3a pkt 1 lit. a) ustawy o VAT podatek z takiej faktury nie może być odliczony. Wystawił ją bowiem podmiot, który był do tego nieuprawniony. Odwołanie się spółki nie przyniosło rezultatu, dlatego sprawa trafiła do warszawskiego WSA.
W skardze spółka sprzeciwiła się pozbawieniu jej prawa do odliczenia wyłącznie na tej podstawie, że wystawca faktur nie zarejestrował się dla celów VAT.
Sąd uchylił decyzję. Zgodził się z organami podatkowymi, że postanowienia art. 88 ust. 3a pkt 1 lit. a) ustawy o VAT w zakresie, w jakim przeciwdziałają nadużyciom, są prawidłowe. Jednak w tej sprawie użycie tego przepisu nie było uzasadnione. Zdaniem sądu pojęcia „podmiot nieuprawniony do wystawienia faktury” oraz „podmiot niezarejestrowany” nie są tożsame. Obowiązek wystawiania faktur dotyczy podmiotów zarejestrowanych jako podatnicy VAT. Jeżeli jednak ktoś nie jest zarejestrowany a wykonuje czynności podlegające opodatkowaniu, ma obowiązek wystawić fakturę VAT i nie można zarzucić mu, że jest do tego nieuprawniony. [b]Sam fakt zapłaty lub brak zapłaty podatku nie ma znaczenia, a niedopełnienie obowiązków rejestracyjnych przez świadczącego dane usługi nie pozbawia jego kontrahenta prawa do odliczenia.[/b]