Niestety, kwestia zaliczenia do kosztów wydatków związanych z podwyższeniem kapitału nie jest jednolicie rozstrzygnięta. Organy podatkowe uważają, że skoro do przychodów w rozumieniu art.12 ustawy o CIT nie zalicza się kwot przeznaczonych na podwyższenie kapitału zakładowego, to wydatki związane z podwyższeniem nie mogą być kosztem podatkowym (na podstawie art. 7 ust. 3 ustawy o CIT).
Nie zmieniają tego podejścia rozstrzygnięcia sądów administracyjnych wskazujące, że podwyższenie kapitału zakładowego nie jest celem samym w sobie, a jedynie zmierza do zwiększenia efektywności działania spółki i w rezultacie do zwiększenia potencjalnego przychodu. Konsekwentnie wymienione wcześniej wydatki należy traktować jako pośrednio związane z przychodami. Jest to bowiem działanie zmierzające do zabezpieczenia przychodu (np. wyrok WSA w Gdańsku z 15 listopada 2007 r., I SA/Gd 753/ 07, wyrok NSA z 22 lutego 2006 r., II FSK 191/05, wyrok NSA z 25 października 2007 r., III SA 769/01).
Sporo wątpliwości wywołuje także sama podstawa prawna, w ramach której urzędy skarbowe wyłączają prawo do zaliczenia wymienionych wydatków do kosztów. Przypomnijmy, że zgodnie z art. 7 ust. 3 pkt 3 ustawy o CIT przy ustaleniu dochodu nie uwzględnia się wydatków dotyczących przychodów pochodzących ze źródeł znajdujących się na terytorium RP, jeżeli:
- dochody z tego źródła nie podlegają opodatkowaniu lub
- są wolne od opodatkowania.
Literalne brzmienie tego przepisu wskazuje zatem, że z kosztów uzyskania przychodów wyłączone są wydatki dotyczące dochodów, które w ogóle nie podlegają opodatkowaniu podatkiem dochodowym (a więc są poza zakresem przedmiotowym ustawy) lub są zwolnione od opodatkowania.