Tak orzekł WSA w Gdańsku 17 lipca br. (I SA/Gd 536/07).
Organy podatkowe zakwestionowały wskazaną przez spółkę wysokość zobowiązania w VAT oraz kwotę podatku do zwrotu. Uznały, że uwzględniła ona w ewidencji faktury wystawione przez podmioty nieuprawnione oraz że prowadziła sprzedaż opodatkowaną i niepodlegającą VAT ("poza ustawą"). Podatek naliczony wynikający z faktur otrzymanych od wystawców niezarejestrowanych, jak i z faktur związanych ze sprzedażą nieopodatkowaną VAT nie mógł być - w ocenie organów - odliczony od VAT należnego.
W skardze do WSA spółka podniosła, że niesłusznie zakwestionowano jej prawo do odliczenia VAT. Nie było przesłanek do określenia struktury sprzedaży na podstawie art. 20 ust. 3 starej ustawy o VAT z 1993 r., ponieważ przepis ten dotyczył sytuacji, w której niemożliwe jest oddzielenie kwot podatku naliczonego związanego wyłącznie ze sprzedażą opodatkowaną i zwolnioną z podatku.
Sąd uwzględnił skargę. Wskazał, że współczynnik udziału sprzedaży opodatkowanej w sprzedaży ogółem można stosować jedynie w celu określenia wysokości podatku naliczonego związanego ze sprzedażą opodatkowaną i zwolnioną od podatku, a taka w spółce nie wystąpiła.
W celu określenia prawidłowej kwoty VAT naliczonego należało uwzględnić wszelkie faktury dokumentujące zakupy towarów, które choćby pośrednio wiązały się ze sprzedażą opodatkowaną. Prawo do odliczenia VAT nie przysługuje tylko wówczas, gdy dany zakup ma związek wyłącznie ze sprzedażą niepodlegającą VAT i niemożliwe jest wykazanie jego związku ze sprzedażą opodatkowaną.
