Interpretacje indywidualne wydawane w imieniu ministra finansów pozwalają podatnikom na bezpieczne rozliczenia podatkowe. Informują ich o stanowisku organów podatkowych odnośnie do wykładni określonych przepisów, a także gwarantują brak negatywnych konsekwencji w przypadku zastosowania się do wydanej interpretacji. Z tych względów interpretacje indywidualne cieszą się niesłabnącą popularnością wśród podatników.
Jednak w pewnych sytuacjach organy odmawiają udzielenia interpretacji. W ostatnich latach wykształciła się kontrowersyjna praktyka odmawiania wydawania interpretacji w sytuacji, gdy podatnicy przedstawiają wiele ewentualnych, wzajemnie się wykluczających wariantów i opcji zdarzenia przyszłego, opisanego we wniosku o wydanie interpretacji. Zdaniem organów podatkowych takie przedstawienie zdarzenia przyszłego służy otrzymaniu porady z zakresu obowiązków podatkowych, służącej optymalizacji podatkowej, a to sprzeciwia się celom instytucji indywidualnych interpretacji.