W związku z tym podatnik po zarejestrowaniu się ma prawo do odliczenia podatku, który wynikał z faktur dotyczących okresu wcześniejszego.
Tak orzekł 2 października 2007 r. WSA w Bydgoszczy (I SA/Bd 435/07)
.
Skarżący korzystał ze zwolnienia podmiotowego od VAT (dla drobnych przedsiębiorców), choć nie miał do tego prawa, gdyż wartość obrotu z tytułu świadczenia usług przekroczyła próg, od którego należało uznać, że jest już obowiązany do rejestracji na VAT. Po pewnym czasie zarejestrował się jako czynny podatnik VAT (złożył zgłoszenie VAT-R).
Organy podatkowe po kontroli określiły prawidłową wysokość jego zobowiązania w VAT, wskazując, że skarżący nie miał prawa do odliczenia podatku naliczonego z faktur za okres, w którym uważał się za zwolnionego od VAT, bo nie zarejestrował się przed wykonaniem pierwszej czynności opodatkowanej. Powołały się na art. 88 ust. 4 ustawy o VAT, zgodnie z którym obniżenia kwoty lub zwrotu różnicy podatku należnego nie stosuje się do podatników, którzy nie są zarejestrowani jako podatnicy VAT czynni. Zdaniem organów podatkowych skarżący nie miał prawa do odliczenia, mimo że potem zarejestrował się jako podatnik VAT.