Historia tego sporu sięga 15 września 2023 r. Tego dnia, na mocy ustawy z 16 sierpnia 2023 r. o zmianie ustawy – Kodeks spółek handlowych („k.s.h.”) i niektórych innych ustaw (DzU 2023.1705), weszła w życie istotna nowelizacja wprowadzająca m.in. art. 515¹ § 1 kodeksu spółek handlowych. Przepis ten umożliwił przeprowadzanie tzw. połączeń bezemisyjnych (horyzontalnych) w sytuacjach, gdy jeden wspólnik posiada wszystkie udziały w łączących się spółkach (np. spółkach siostrach) lub gdy wspólnicy posiadają udziały w tej samej proporcji we wszystkich podmiotach.
Z perspektywy biznesowej była to ważna zmiana. Uproszczona procedura pozwala na rezygnację z wielu czasochłonnych i kosztownych formalności: podwyższania kapitału zakładowego spółki przejmującej, ustalania parytetu wymiany udziałów, a także z obowiązku badania planu połączenia przez biegłego rewidenta. Celem było ułatwienie i przyspieszenie konsolidacji w ramach grup kapitałowych, co miało prowadzić do oszczędności administracyjnych, synergii operacyjnych i uproszczenia zarządzania.
Niestety pierwotnie za nowelizacją k.s.h. nie podążyły odpowiednie zmiany w ustawie z 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych („ustawa o CIT”). To zrodziło fundamentalny problem, który skupił się w szczególności wokół interpretacji art. 12 ust. 1 pkt 8d ustawy o CIT. Zgodnie z tym przepisem w jego brzmieniu przed 18 września 2025 r. przychodem spółki przejmującej jest nadwyżka wartości rynkowej majątku spółki przejmowanej nad wartością emisyjną udziałów wydanych jej wspólnikom. Co jednak w sytuacji, gdy – zgodnie z nową, uproszczoną procedurą – żadne udziały nie zostały wyemitowane?
Rygorystyczne stanowisko fiskusa
Na powyższe pytanie w wydawanych interpretacjach prawa podatkowego organ udzielał, co do zasady, niekorzystnej dla podatników odpowiedzi. W licznych interpretacjach indywidualnych organy podatkowe przyjęły literalną wykładnię przedmiotowego przepisu. Skoro w połączeniu bezemisyjnym nie wydaje się nowych udziałów, to ich „wartość emisyjna” wynosi zero. W konsekwencji cała wartość rynkowa przejmowanego majątku staje się przychodem podlegającym opodatkowaniu po stronie spółki przejmującej.
Niekorzystne dla podatników stanowisko zostało zaprezentowane przykładowo w interpretacji z 20 lutego 2025 r. (sygn. 0114-KDIP2-2.4010.689.2024.2.SP), gdzie organ podatkowy wskazał, że w sytuacji gdy ten sam podmiot posiada 100 proc. udziałów zarówno w spółce przejmującej, jak i przejmowanej, a w związku z połączeniem nie są emitowane ani wydawane nowe udziały, po stronie spółki przejmującej powstaje przychód w wysokości wartości rynkowej majątku spółki przejmowanej, ustalony na dzień poprzedzający dzień połączenia. Podobne wnioski zaprezentowano w interpretacji indywidualnej z 29 maja 2025 r. (sygn. 0114‑KDIP2‑2.4010.167.2025.1.SJ), w której organ wskazał, że w przypadku połączenia uproszczonego na podstawie art. 515¹ k.s.h. – przeprowadzanego między spółkami siostrami mającymi tego samego wspólnika, gdy nie dochodzi do przyznania nowych udziałów wspólnikowi, po stronie spółki przejmującej powstaje przychód odpowiadający wartości rynkowej majątku spółki przejmowanej, stanowiąc tym samym nadwyżkę w rozumieniu art. 12 ust. 1 pkt 8d ustawy o CIT.