Przygotowana przez rząd nowelizacja wprowadza wiele zmian. Najważniejsze dotyczą podatkowego uregulowania nieodpłatnego przekazywania towarów i nieodpłatnego świadczenia usług opieki medycznej (pakiety medyczne), obrotu złomem oraz usług przeładunku towaru w portach morskich.
Dotychczas nieodpłatne przekazywanie towarów było zwolnione z VAT, pod warunkiem że było związane z prowadzoną działalnością gospodarczą. Chociaż fiskus kwestionował tę zasadę, znajdowała ona uzasadnienie w przepisach ustawy i potwierdzały to sądy administracyjne. Po zmianach, niezależnie od tego, czy przekazanie będzie związane z działalnością firmy czy nie, zwolnienie nie będzie przysługiwało. Wyjątkiem będą prezenty o małej wartości oraz próbki.
W przypadku nieodpłatnego świadczenia usług zmiana polega na obowiązku naliczenia podatku przez świadczącego usługi, nawet jeśli jemu samemu nie przysługiwało prawo do odliczenia VAT przy ich wcześniejszym nabyciu. Dotychczas w takich sytuacjach na usługi nie był nakładany podatek.
Nowelizacja wyjaśnia też kwestię obowiązku naliczania podatku od pakietów medycznych nabywanych przez firmy na rzecz pracowników. Obecnie problem budzi wątpliwości, po zmianach sytuacja ma być jasna: pakiety będą korzystały ze zwolnienia z VAT. Senackie poprawki wyjaśniają też zakres stosowania preferencyjnej stawki O proc. do usług świadczonych na obszarze portów morskich. Będzie ona miała zastosowanie do obsługi środków transportu lądowego, morskiego i żeglugi śródlądowej, łącznie ze składowaniem ładunków do 60 dni, a w przypadku kontenerów 20 dni.
Kolejna zmiana wynika z potrzeby usunięcia patologii w obszarze szczególnie na nie podatnym, czyli branży obrotu złomem.