- koszty bezpośrednie: zużyte materiały, koszty wynagrodzeń w danym zakładzie, inne koszty pozyskania i przetworzenia związane bezpośrednio z produkcją w danym zakładzie, oraz
- uzasadnioną część kosztów pośrednich.
Nie należy utożsamiać pojęć „koszty pośrednie produkcji” i „koszty wspólne”. Kosztów pośrednich nie można przypisać do kosztów wytworzenia określonego wyrobu inaczej, aniżeli poprzez zastosowanie klucza rozliczeniowego (np. amortyzacja budynków produkcyjnych, płace kierownictwa produkcji, koszty zużycia energii na wydziale produkcyjnym itp.). Koszty te podlegają alokacji odpowiednio do źródeł opodatkowanych i zwolnionych poprzez ich skalkulowanie do wartości technicznego kosztu wytworzenia.
Można mieć pewne wątpliwości co do alokacji kosztów pośrednich w sytuacji, gdy np. na tym samym wydziale produkcyjnym wytwarzane są jednocześnie wyroby określone w zezwoleniu i nieobjęte zezwoleniem. Wówczas te same koszty pośrednie będą jednocześnie dotyczyć działalności zwolnionej i opodatkowanej, co oznaczałoby konieczność rozliczenia kluczem przychodowym (patrz dalej), a nie kluczami przyjętymi zgodnie z zasadami rachunkowości.
Moim zdaniem takie postępowanie nie byłoby jednak prawidłowe. Przepisy podatkowe nie regulują zasad wyceny zapasów i w tym względzie należy stosować zasady rachunkowości. Skoro, zgodnie z tymi zasadami, przychodom ze sprzedaży wyrobów odpowiada koszt własny sprzedanych wyrobów skalkulowany na poziomie kosztów wytworzenia, obejmujących uzasadnioną część kosztów pośrednich, koszty te należy uznać za związane z przychodami dla celów podatkowych. Tym samym odpowiednio do przychodów ze sprzedaży wyrobów strefowych i pozastrefowych należy odnieść koszt wytworzenia tych wyrobów.
Kosztami wspólnymi są wydatki związane zarówno z działalnością opodatkowaną, jak i zwolnioną. Zasady ich alokacji określa art. 15 ust. 2 ustawy o CIT, który mówi, że jeśli podatnik ponosi koszty uzyskania przychodów ze źródeł, z których dochód podlega opodatkowaniu, oraz koszty związane z przychodami z innych źródeł, a nie jest możliwe ustalenie kosztów uzyskania przypadających na poszczególne źródła, koszty te ustala się w takim stosunku, w jakim pozostają przychody z tych źródeł w ogólnej kwocie przychodów.