- dla spółki przejmującej, która posiada w kapitale zakładowym spółki przejmowanej udział w wysokości nie mniejszej niż 10 proc., bądź też nie posiada go w ogóle, dochodem nie będzie nadwyżka wartości otrzymanego przez spółkę przejmującą majątku spółki przejmowanej ponad nominalną wartość udziałów (akcji) przyznanych udziałowcom (akcjonariuszom) spółki przejmowanej,
- przy połączeniu spółek poprzez zawiązanie nowej spółki kapitałowej – nadwyżka wartości otrzymanego przez nową spółkę majątku będącego majątkiem wszystkich spółek uczestniczących w transakcji połączenia ponad nominalną wartość udziałów (akcji) przyznanych udziałowcom (akcjonariuszom) spółek przejmowanych nie jest dochodem dla nowo zawiązanej spółki.
Generalnie co do zasady tran- sakcja połączenia spółek kapitałowych nie skutkuje powstaniem dodatkowego dochodu do opodatkowania podatkiem dochodowym dla którejkolwiek ze spółek uczestniczących w procesie połączenia. Oznacza to, że samo w sobie połączenie może być neutralne podatkowo. Jednak należy dowieść, że ma ono ekonomicznie uzasadniony sens. W przypadku jego braku organy podatkowe zwrócą uwagę na konieczność opodatkowania nadwyżki wartości majątku przyjętego przez spółkę przejmującą powyżej nominalnej wartości udziałów (akcji) przekazanych udziałowcom (akcjonariuszom) spółki przejmowanej w momencie połączenia spółek.
Ustawa o CIT wyraźnie wyklucza stosowanie przepisów zwalniających z ustalania dochodów i rozpoznawania przychodu w przypadku połączenia, jeżeli połączenie spółek jest przeprowadzone bez uzasadnionych przyczyn ekonomicznych, a głównym bądź należącym do głównych motywów takich transakcji jest uchylenie się od opodatkowania (art. 10 ust. 4 ustawy o CIT). Z pewnością ustawodawca, posługując się tym przepisem wyraźnie wyklucza z preferencji podatkowej podmioty niemające takiego uzasadnienia, lecz nie precyzuje, co ma stanowić sensu stricte taki uzasadniający dokument. Efektem tego jest różnorodna linia interpretacyjna oraz ryzyko wystąpienia dochodu do opodatkowania.
Praktyka pokazuje, że połączenia następują przede wszystkim z przyczyn ekonomicznych. Można wśród nich wskazać: przeprowadzenie restrukturyzacji struktur biznesowych w celu ich uproszczenia, realizację nowo przyjętej strategii rozwoju organizacji, zużycie niewykorzystanych mocy produkcyjnych, usprawnienie procesów logistycznych, a także konieczność obniżenia kosztów zarządzania i prowadzenia działalności. Są to najczęściej podawane przyczyny w ekonomicznym uzasadnieniu połączenia, jednak nie gwarantują neutralności podatkowej.