Przedsiębiorca strefowy może prowadzić działalność również poza terenem strefy, jednak zwolnieniem podatkowym objęte są wyłącznie dochody osiągnięte z działalności prowadzonej w strefie i w zakresie działalności określonej w zezwoleniu. Zatem przedsiębiorcy strefowi prowadzący działalność inną niż określona w zezwoleniu bądź prowadzący, oprócz działalności w strefie, równolegle działalność poza strefą mają obowiązek wyodrębnienia z ogółu dochodów takich, które są zwolnione z podatku. Pozostałe osiągane przez nich dochody podlegają opodatkowaniu na zasadach ogólnych.
Konieczność ustalania odrębnych wyników z działalności zwolnionej i opodatkowanej dla przedsiębiorców strefowych wynika z ogólnego zakazu łączenia dochodów i strat ze źródeł opodatkowanych i zwolnionych.
Zgodnie z art. 7 ust. 3 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych (dalej updop), przy ustalaniu dochodu stanowiącego podstawę opodatkowania nie uwzględnia się:
1) przychodów ze źródeł położonych na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej lub za granicą, jeżeli dochody z tych źródeł nie podlegają opodatkowaniu podatkiem dochodowym albo są wolne od podatku,
2) kosztów uzyskania przychodów, o których mowa w pkt 1.Takie same zasady obowiązują przy ustalaniu strat.
