Organy podatkowe mają pięć lat (licząc od końca roku kalendarzowego, w którym upłynął termin płatności podatku) na kontrolę wymiaru zobowiązania oraz wyegzekwowanie niezapłaconego lub zapłaconego w zaniżonej wysokości podatku. Po tym czasie zobowiązanie podatkowe ulega przedawnieniu. A to oznacza, że fiskus nie może dochodzić zapłaty zaległości podatkowych.
Pięć lat (okres ten może być wydłużony w razie wystąpienia zdarzeń powodujących przerwanie lub wstrzymanie biegu terminu przedawnienia) powinno wystarczyć, by przeprowadzić postępowanie zmierzające do określenia prawidłowej wysokości podatku, a następnie jego wyegzekwowanie. W praktyce jednak organom skarbowym często nie udaje się wymusić na podatniku zapłaty należnego (ich zdaniem) podatku. Powód to zbyt późne wszczęcie postępowania.
W przeszłości zarzucano organom skarbowym, że celowo zwlekają z wymiarem zaległości podatkowej do ostatniej chwili po to, by uzyskać od podatnika wyższe odsetki za zwłokę. Obowiązujące do końca 2002 roku przepisy mogły skłaniać urzędy do takich działań. Odsetki od zaległości podatkowych były bowiem naliczane za cały okres od upływu terminu płatności podatku do zapłaty wymierzonej decyzją zaległości – bez względu na to, ile czasu upłynęło od zakończenia kontroli podatkowej do wszczęcia postępowania wymiarowego.
Od 2003 r. sytuacja jednak się zmieniła za sprawą nowelizacji ordynacji podatkowej (op). Teraz nie nalicza się odsetek za zwłokę za okres od dnia wszczęcia kontroli podatkowej do dnia doręczenia decyzji w sprawie, która była przedmiotem kontroli, jeżeli postępowanie nie zostało wszczęte w ciągu trzech miesięcy od dnia jej zakończenia (art. 54 § 1 pkt 6 op). Nie są również naliczane odsetki za zwłokę za okres od dnia wszczęcia postępowania podatkowego do dnia doręczenia decyzji organu pierwszej instancji, jeśli decyzja nie została doręczona w ciągu trzech miesięcy od dnia wszczęcia postępowania (art. 54 § 1 pkt 7 op).
Opóźnianie momentu wszczęcia postępowania wymiarowego czy też przewlekłe prowadzenie takiego postępowania nie przynosi już budżetowi państwa dodatkowych korzyści w postaci odsetek za zwłokę. Przyczyn wydawania decyzji podatkowych tuż przed upływem terminu przedawnienia należy zatem szukać gdzie indziej.