Niemniej jednak przedsiębiorstwo ma dowolną możliwość aranżacji planu szkoleń. Może on obejmować wszystkie grupy docelowe pracowników i zapewniać każdej z grup inny rodzaj szkolenia. Dodatkowo przedsiębiorca może jednocześnie prowadzić szkolenia własną kadrą szkoleniową (jeśli taką ma), objąć usługami partnera wybrane grupy pracowników lub szkolenia (partnerem jest firma szkoleniowa, która z przedsiębiorcą tworzy na czas projektu konsorcjum – nie jest to jednak praktyka obowiązkowa) oraz korzystać z usług firm szkoleniowych lub innych trenerów specjalistów na zasadzie podwykonawstwa.
Realizując projekty współfinansowane przez Europejski Fundusz Społeczny, przedsiębiorca korzysta z możliwości promocji projektu oraz przedsiębiorstwa. Za koszty kwalifikowane, czyli podlegające częściowej refundacji, uznaje się kampanie informacyjno-promocyjne, umieszczanie informacji w prasie, na stronach internetowych, przygotowanie ulotek, plakatów oraz inne formy promocji.
Jeżeli przedsiębiorca ma własny dział szkoleniowy i deleguje jego pracowników do pracy wyłącznie przy realizacji współfinansowanego szkolenia, wówczas koszty pracy tych osób (rozumiane jako wynagrodzenie netto wraz ze składkami pracodawcy na ubezpieczenie społeczne, z wyłączeniem składki na PFRON, z zaliczką na podatek dochodowy, ze składkami na Fundusz Pracy i Zakładowy Fundusz Świadczeń Socjalnych oraz z regulaminowymi premiami) stanowią również koszt kwalifikowany.
Kolejne koszty, które mogą zostać częściowo zrefundowane, to chociażby amortyzacja środków trwałych niezbędnych do realizacji szkoleń, takich jak np.: komputery, rzutniki multimedialne, kamery cyfrowe. Pokrywane są również koszty związane z zapewnieniem uczestnikom materiałów szkoleniowych, gadżetów promocyjnych czy poczęstunku w trakcie przerwy.
W ramach projektu przedsiębiorca musi przedstawić metodologię liczenia kosztów pośrednich, które w zależności od wartości projektu (do 2 mln zł, 2 – 5 mln zł, powyżej 5 mln zł) mogą odpowiednio stanowić 20, 15 lub 10 proc. Do kosztów pośrednich zalicza się m.in.: obsługę księgową, opłaty administracyjne za najem powierzchni biurowych lub czynsz, ubezpieczenia majątkowe, koszty zarządu, materiały biurowe i piśmiennicze, usługi pocztowe, kurierskie, opłaty za energię cieplną, gazową i wodę, opłaty przesyłowe itp.
Reasumując, realizacja projektu szkoleniowego współfinansowanego przez EFS może częściowo pokryć koszty stałe prowadzenia przedsiębiorstwa, co stanowi dla niego wartość dodaną. Dotacja wypłacana jest w systemie ratalnym, a pierwsza transza stanowi zaliczkę.