Cechy stosunku pracy wynikają bezpośrednio z Kodeksu pracy. Jedną z nich jest podporządkowanie pracownika pracodawcy. W przypadku wspólników sp. z o.o. problem polega na tym, iż w rzeczywistości członek zarządu, będący jednocześnie wspólnikiem spółki, byłby podporządkowany sam sobie. Ponieważ w zdecydowanej większości takich spółek członkami zarządu są jej wspólnicy lub nawet jedyny wspólnik, to kwestia ta bardzo często trafia do rozstrzygnięcia przez sądy. Orzecznictwo sądowe w tym zakresie stanęło na stanowisku, iż takie zatrudnienie, co do zasady, jest dopuszczalne. Powstaje wówczas tzw. podporządkowanie autonomiczne, które polega na tym, że pracownik realizuje przekazane mu zadania. Respektując uchwały wspólników, samodzielnie decyduje o sposobie ich realizacji i wypełnianiu obowiązków wynikających z przepisów, w szczególności Kodeksu spółek handlowych. W tym systemie podporządkowania pracowniczego pracodawca określa godziny czasu pracy i wyznacza zadania, ale sposób ich realizacji pozostaje w gestii pracownika. Niemniej jednak w praktyce powstaje wiele kontrowersji, zaś zasada ta ulega wielu wyjątkom w zależności od struktury spółki.