Według Forum Obywatelskiego Rozwoju zasada in dubio pro tributario powinna być stosowana przez organy podatkowe, ponieważ – po pierwsze – jest fundamentem każdego cywilizowanego systemu podatkowego. Po drugie, zgodnie z orzecznictwem Trybunału Konstytucyjnego, już teraz wynika wprost z Konstytucji.
FOR zwraca jednak uwagę, że brzmienie tej zasady zaproponowane w prezydenckim projekcie nowelizacji: „niedające się usunąć wątpliwości co do treści przepisów prawa podatkowego rozstrzyga się na korzyść podatnika" w praktyce pozwoliłoby organom podatkowym na unikanie jej stosowania. Zgodnie z projektem zasada in dubio pro tributario dotyczyłaby jedynie „wątpliwości co do treści przepisów prawa podatkowego".