Tak orzekł Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 29 listopada 2013 r. ?(I FSK 1763/12).
Spółka prowadziła działalność, ?w ramach której wykonywała usługi ?w zakresie edukacji objęte zwolnieniem na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT. Spółka nie odliczała VAT naliczonego przy zakupie towarów i usług związanych z działalnością. We wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej zadała pytanie, czy ma prawo odliczyć podatek naliczony od początku działalności. Zdaniem podatnika prawo do odliczenia przysługiwało mu wraz z rozpoczęciem działalności, ponieważ postanowienia art. 43 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT naruszały normy zarówno VI, jak i 112 dyrektywy, zbyt szeroko zakreślając zawarte tam zwolnienie.
Organ przyznał, że w przypadku czynności, które w przepisach prawa krajowego korzystały ze zwolnienia, a w przepisach prawa wspólnotowego podlegają opodatkowaniu, podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia VAT, niemniej podatnik nie może się powoływać na dyrektywę w celu domagania się prawa do odliczenia podatku naliczonego, nie płacąc podatku należnego. Mając to na uwadze, organ uznał stanowisko spółki za nieprawidłowe.
Sąd I instancji uchylił interpretację, przyznając rację podatnikowi, jednak NSA, rozpatrując skargę kasacyjną, podzielił stanowisko organu podatkowego. Powołał się na wyrok Trybunału Sprawiedliwości UE ?z 28 listopada 2013 r., w którym Trybunał stwierdził, że na podstawie art. 168 dyrektywy 112 podatnik nie może się powoływać na prawo do odliczenia VAT, jeżeli ze względu na zwolnienie przewidziane przez prawo krajowe dane usługi nie były opodatkowane.
—Amelia Sawerska, współpracowniczka Zespołu Zarządzania Wiedzą Podatkową ?firmy Deloitte