Samorządowcy, którzy bez centralizacji rozliczeń po wyroku Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej (TSUE) chcieli odzyskać VAT, oraz podatnicy spierający się ze skarbówką o przedłużenie terminu do zwrotu tej daniny muszą uzbroić się w cierpliwość. Zaplanowane na poniedziałek wydanie uchwał Naczelnego Sądu Administracyjnego w tych sprawach nie zakończyło się sukcesem.
Pierwszy spór dotyczy gmin, które po latach odmiennej praktyki zostały uznane za jednego podatnika VAT. Wymusiło to zmianę przepisów i wprowadzenie centralizacji rozliczeń VAT w gminie. Problemem okazał się okres po orzeczeniu Trybunału Sprawiedliwości UE, który oficjalnie potwierdził, że tylko gmina może być zarejestrowana dla celów VAT (sprawa C-276/14, gmina Wrocław) do chwili wprowadzenia przepisów regulujących zasady centralizacji rozliczeń. NSA miał rozstrzygnąć, czy w stanie prawnym obowiązującym przed 1 października 2016 r. jednostka samorządu terytorialnego, która w związku z wyrokiem TSUE chciała wykorzystać prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur zakupowych związanych z inwestycją przekazanych nieodpłatnie jednostce budżetowej, była zobowiązana do korekt rozliczeń podatku łącznie wszystkich jednostek organizacyjnych i gminy. Inaczej mówiąc, czy gmina mogła odzyskać VAT np. tylko od jednej inwestycji, czy musiała scentralizować rozliczenia wszystkich swoich jednostek.