Tak wynika z przepisów i przyznał to też minister finansów w piśmie z 25 kwietnia 2008 r. (odpowiedź na interpelację poselską nr 2447). Przedsiębiorca może skorygować deklarację po kontroli podatkowej prowadzonej przez urząd kontroli skarbowej. Mówi o tym art. 14c ustawy o kontroli skarbowej. Potwierdziło to Ministerstwo Finansów w piśmie z 13 lutego 2007 r. (AP13-8012/62/PZ/07/274).
Inaczej jest w przypadku kontroli prowadzonej przez urząd skarbowy. Wprawdzie aż do momentu wszczęcia postępowania podatkowego można poprawić błędy, ale z przepisów wynika, że nie dotyczy to deklaracji VAT. Chodzi o art. 81b § 3 ordynacji podatkowej, zgodnie z którym reguły „uprawnienie do skorygowania deklaracji przysługuje nadal po zakończeniu kontroli podatkowej” nie stosuje się w zakresie VAT.
Czy oznacza to, że firma, w której kontrolerzy z urzędu skarbowego sprawdzali VAT, nie może już poprawić swoich błędów za weryfikowany okres? Może to zrobić, jeśli kontrola nie stwierdziła nieprawidłowości – tak wynika z pisma Ministerstwa Finansów z 8 sierpnia 2005 r. (SP 1/618/8012-110-2024/05/EB) wydanego po zmianie zasad składania korekt. Czytamy w nim: „brak jest merytorycznego i praktycznego uzasadnienia dla uznania bezwzględnej bezskuteczności korekty deklaracji VAT w każdej sytuacji po zakończeniu kontroli podatkowej. Dodany przepis art. 81b § 3 ordynacji podatkowej miał jedynie zachować, już tylko w formie wyjątku dotyczącego podatku od towarów i usług, obecny stan prawny, a więc pozostawić podatnikom prawo do złożenia prawnie skutecznej korekty deklaracji VAT, gdy zakończona kontrola nie wykazała nieprawidłowości. Korekta deklaracji złożona w tym wypadku będzie prawnie skuteczna. Jedynie w sytuacji gdy kontrola podatkowa wykaże nieprawidłowości, a zebrany w toku kontroli materiał dowodowy będzie przyczynkiem do wszczęcia postępowania podatkowego korekta deklaracji w zakresie podatku od towarów i usług nie będzie prawnie skuteczna”.
Także w piśmie z 25 kwietnia 2008 r. minister finansów stwierdził, że ordynacja podatkowa „wyłącza prawo do skorygowania deklaracji w podatku od towarów i usług w zakresie objętym ustaleniami (oceną prawną) protokołu kontroli, które następnie mogą być przyczyną wszczęcia postępowania podatkowego”.
Tak więc z wyjaśnień ministra finansów wynika, że nie można korygować deklaracji VAT po zakończeniu kontroli urzędu skarbowego, która wykaże nieprawidłowości. Czy dotyczy to również weryfikacji prowadzonej przez urząd kontroli skarbowej? Nie, gdyż w ustawie o kontroli skarbowej nie ma ograniczeń przewidzianych w ordynacji podatkowej. Jak czytamy w wyjaśnieniach Ministerstwa Finansów z 13 lutego 2007 r.: „Art. 14c ustawy o kontroli skarbowej kompleksowo reguluje kwestię korygowania deklaracji po zakończeniu kontroli skarbowej, w tym korygowania deklaracji w zakresie podatku od towarów i usług. Oznacza to, że art. 81b § 3 ustawy Ordynacja podatkowa nie ogranicza prawa do korekty tych deklaracji po zakończeniu kontroli skarbowej, która wykazała nieprawidłowości”.
