Mimo iż klauzula dotycząca rozstrzygania wątpliwości na korzyść podatników obowiązuje od początku 2016 r., Ministerstwo Finansów nie potrafi wskazać żadnego realnego przypadku, w jakim ją zastosowano. Chodzi o art. 2a ordynacji podatkowej, zgodnie z którym niedające się usunąć wątpliwości co do treści prawa podatkowego rozstrzyga się na korzyść podatnika. Resort przedstawił swoje stanowisko w tej sprawie w odpowiedzi na interpelację poselską nr 6001.
Poseł Anna Nemś zapytała, dlaczego organy podatkowe nie stosują zasady „in dubio pro tributario". Wiceminister Wiesław Janczyk zaprotestował, że „postawiona w interpelacji teza nie znajduje potwierdzenia".