Inne, tzw. dokumenty pomocnicze, których przykładowy katalog zawarto w art. 42 ust. 12 ustawy o VAT, mogły być, zdaniem fiskusa, wykorzystywane jedynie wtedy, gdy dokumenty podstawowe nie potwierdzały jednoznacznie dostarczenia towarów do unijnego kontrahenta. Innymi słowy, aby zastosować zerową stawkę, należało mieć fakturę ze specyfikacją i dokument przewozowy (najczęściej tzw. CMR).
Podatnicy natomiast uważali, że zerowa stawka VAT może być stosowana także wtedy, gdy mają „tylko” fakturę, w której zawarto specyfikację towaru, oraz informację od kontrahenta np. w formie e-maila czy innej korespondencji, że towar do niego dotarł.
Korzystne orzecznictwo
Przykładem sporu w tym zakresie może być sprawa rozstrzygnięta przez Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie korzystnym dla podatnika wyrokiem z 27 września 2007 (III SA/Wa 1210/07).
Sąd uznał, że jeżeli podatnik nie jest w stanie zgromadzić dokumentów wymienionych w katalogu podstawowym, powinien mieć prawo do zastosowania dowodów pomocniczych, określonych w art. 42 ust. 11 ustawy o VAT.
Zdaniem sądu nie ma również podstaw do odmawiania mocy dowodowej dokumentowi w formie elektronicznej lub przesłanemu faksem. Za tą formą dokumentowania WSA w Warszawie opowiedział się także w wyroku z 12 lutego 2009 (III SA/Wa 1909/ 08).
To stanowisko potwierdzone zostało w uchwale Naczelnego Sądu Administracyjnego z 11 października 2010 (I FPS 1/10).