Tak orzekł WSA w Warszawie w wyroku z 9 lipca 2008 r. (VIII SA/Wa 119/08).
Określając podstawę opodatkowania dla celów VAT, spółka uwzględniła stratę z tytułu organizacji imprezy turystycznej, co skutkowało zmniejszeniem kwoty podatku należnego. Urząd skarbowy zakwestionował to rozliczenie, wskazując, że art. 119 ustawy o VAT nie przewiduje możliwości uwzględnienia tzw. marży ujemnej przy obliczaniu zobowiązania podatkowego. Spółka odwołała się do izby skarbowej, która stwierdziła, że nie ma możliwości uwzględnienia w rozliczeniach VAT straty z tytułu świadczenia usług turystyki. Zdaniem organu jeżeli w wyniku obliczeń zostanie określona ujemna kwota marży z tytułu świadczenia tych usług, to należy uznać, że marża nie wystąpiła. Podatnik nie może domagać się zwrotu VAT od poniesionej straty.
Spółka wniosła na tę decyzję skargę do WSA w Warszawie. Argumentowała, że obliczając zobowiązanie podatkowe na zasadach marży, należy także respektować ogólne zasady VAT, w tym zasadę neutralności.
Sąd uchylił zaskarżoną decyzję, wskazując, że z ustawy o VAT oraz dyrektywy 112 nie wynika zakaz uwzględnienia tzw. marży ujemnej. Mając na względzie zasadę neutralności VAT, należy przyjąć, że istnieje możliwość pomniejszania podstawy opodatkowania o rzeczywistą stratę wynikającą z rozliczenia dokonanego zgodnie z art. 119 ustawy o VAT. Pozbawienie podatnika możliwości uwzględniania ujemnej kwoty marży stanowi obciążenie go zawartym w cenie nabywanych towarów i usług podatkiem, który powinien płacić ostateczny konsument usług turystyki.
Sąd potwierdził ponadto, że faktury korygujące dotyczące nabywanych dla turystów usług nie powodują konieczności wstecznej korekty wcześniej ustalonej marży i mogą być ujmowane w rozliczeniach na bieżąco.
