Sprawa dotyczyła samorządowej instytucji kultury – centrum sztuki współczesnej, która miała wątpliwości co do rozliczenia VAT. We wniosku o interpretację wyjaśniła, że jednym z jej zadań statutowych jest prowadzenie biblioteki. Tylko w tym zakresie jej aktywność nie jest związana z działalnością gospodarczą.
Dalej podatniczka tłumaczyła, że w związku ze zmianą ustawy o VAT, do określenia wskaźnika proporcji zgodnie z art. 86 ust. 2c ustawy o VAT przyjęła średnioroczną powierzchnię wykorzystywaną do działalności gospodarczej w ogólnej średniorocznej powierzchni wykorzystywanej do działalności gospodarczej i poza nią. W jej ocenie metoda powierzchniowa najbardziej odpowiada specyfice wykonywanej działalności oraz jest reprezentatywnym sposobem określania proporcji.
Fiskus nie podzielił tego stanowiska. Po analizie przepisów uznał, że wskazana przez podatniczkę metoda powierzchniowa (określona w art. 86 ust. 2c pkt 4 ustawy o VAT) nie jest właściwa dla sposobu określania proporcji. W jego ocenie właściwym sposobem jest ten z § 4 ust. 1 rozporządzenia ministra finansów z 17 grudnia 2015 r. w sprawie sposobu określania zakresu wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów działalności gospodarczej w przypadku niektórych podatników (dalej: rozporządzenie w sprawie proporcji). Ustawodawca uznał go za najbardziej odpowiadający specyfice wykonywanej działalności i dokonywanych nabyć w przypadku samorządowej instytucji kultury.
To stanowisko ostatecznie potwierdził też Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie.
Sąd zauważył, że w art. 86 ust. 2c ustawy o VAT ustawodawca przedstawił przykładowe dane, które można wykorzystać przy wyborze sposobu określania proporcji, w tym związane z powierzchnią wykorzystywaną do działalności gospodarczej. Wymienił też dane związane z zatrudnieniem czy dotyczące otrzymywanych przez podatnika dotacji, subwencji i innych dopłat o podobnym charakterze, otrzymanych na sfinansowanie wykonywanej przez podatnika działalności innej niż gospodarcza. W ocenie WSA z art. 86 ust. 2a–2c ustawy o VAT wynika zatem, że przyjęcie właściwego sposobu określania proporcji jako najbardziej odpowiadającego specyfice wykonywanej przez podatnika działalności i dokonywanych przez niego nabyć wymaga od podmiotów takich jak skarżąca (samorządowa instytucja kultury) znacznej aktywności dowodowo-analitycznej.