Przykładowo Urząd Skarbowy w Legnicy stwierdził, że ustawa o VAT "nie ogranicza w żaden sposób prawa do odliczenia podatku naliczonego od napraw, których przedmiotem są samochody osobowe" (pismo z 6 marca 2006 r., PP/44322/06). Także według Pierwszego Urzędu Skarbowego w Opolu: "Niezależnie od tego, czy nabywane są części składowe (zamienne), które posłużą do naprawy czy ulepszenia samochodu, jak również czy będą one użyte do remontu (ulepszenia) samochodu osobowego czy ciężarowego - odliczenie przysługuje na ogólnych zasadach" (pismo z 14 maja 2004 r., PP/443-36-2/04).
Identyczne stanowisko zajął Urząd Skarbowy w Płocku, zezwalając na pełne odliczenie VAT od zakupionej instalacji gazowej montowanej w samochodzie osobowym będącym środkiem trwałym firmy (pismo z 30 listopada 2005 r., 1419/ UPO-443-111/05/RS).
A co w sytuacji, gdy ulepszymy zupełnie nowy samochód osobowy, który kupiliśmy w salonie w wersji podstawowej? Załóżmy, że ten zakup został udokumentowany fakturą, z której odliczyliśmy 6 tys. zł VAT. Ale po zakupie zażyczyliśmy sobie montażu dodatkowego wyposażenia (np. klimatyzacji, radia, autoalarmu), na co otrzymaliśmy odrębną fakturę VAT. Czy mamy prawo do odliczenia z niej VAT? Nie ma ku temu przeciwwskazań. Potwierdzają to wyjaśnienia Pierwszego Śląskiego Urzędu Skarbowego w Sosnowcu z 10 stycznia 2006 r. (PSUS/PPO I/443/402/05/BPM). Dotyczyły one przedsiębiorcy, który kupił pojazd o ładowności 2800 kg za około 96 tys. zł (VAT około 21 tys. zł). Następnie przystosował go do monitorowania sieci wodociągowych, kupując ruchome wyposażenie na łączną kwotę około 120 tys. zł (VAT ok. 26 tys. zł). Urząd uznał, że ograniczenie w odliczaniu VAT do 6 tys. zł dotyczy tylko faktury na zakup pojazdu. Podatek z faktury na jego adaptację może być odliczony w całości.
Faktura, która dokumentuje zakupy paliwa wlewanego do baku każdego samochodu (lub innego pojazdu samochodowego), musi zawierać jego numer rejestracyjny. Tak wynika z § 9 ust. 5 rozporządzenia ministra finansów z 25 maja 2005 r. regulującego zasady wystawiania faktur (DzU nr 95, poz. 798 ze zm.). Może być też wystawiona zbiorcza faktura potwierdzająca zakup paliwa do kilku samochodów, ale powinny być na niej wykazane wszystkie ich numery rejestracyjne (tak pismo Urzędu Skarbowego w Białej Podlaskiej z 28 października 2005 r., PP/443-62/05).
Może być problem, gdy wlewamy paliwo nie do baku, tylko do beczki bądź stacjonarnego zbiornika na terenie firmy. Wówczas, jak wyjaśnił Drugi Urząd Skarbowy w Rzeszowie w piśmie z 19 maja 2006 r. (IUS-II-443/71/2006), "w celu uprawdopodobnienia faktu wykorzystania paliwa do napędu konkretnych pojazdów zasadne byłoby dołączenie do faktury oświadczenia dotyczącego ilości zużytego paliwa z wyszczególnieniem numerów rejestracyjnych pojazdów lub dowodów wydania tego paliwa zawierających numery rejestracyjne pojazdów, do których zostało wlane paliwo".