Dużo zależy od tego, czy podatnik wcześniej wystawił fakturę albo otrzymał zaliczkę.
Regułą jest, że przy wewnątrzwspólnotowej dostawie towarów (WDT) obowiązek podatkowy powstaje 15 dnia miesiąca następującego po miesiącu, w którym miała miejsce dostawa towarów. Ustawodawca nie sprecyzował, w którym momencie dokonujemy dostawy towarów. Moim zdaniem może to być moment, w którym na nabywcę przechodzi prawo do rozporządzania rzeczą jak właściciel. Można zatem przyjąć, że w przypadku gdy w dostawie stosowane są warunki ex works (tj. sprzedający jest zobowiązany do postawienia towaru kupującemu do dyspozycji na swoim terenie, bez ponoszenia jakiegokolwiek ryzyka, dodatkowych kosztów transportu czy załadunku), odebranie towaru przez nabywcę lub przez osobę działającą w imieniu i na rachunek nabywcy oznacza dokonanie dostawy. Natomiast jeżeli dostawca ma obowiązek dostarczenia towaru do miejsca określonego przez nabywcę, np. na warunkach DAF, DES, DEQ, DDU, DDP (tj. sprzedający jest zobowiązany do poniesienia wszystkich kosztów i rodzajów ryzyka związanych z towarem aż do momentu, gdy zostanie on przekazany do miejsca przeznaczenia), wówczas dopiero dostarczenie tego towaru we wskazane miejsce będzie równoznaczne z dokonaniem dostawy.
Jednakże w przypadku gdy przed upływem 15 dnia miesiąca następującego po miesiącu, w którym dokonano dostawy towarów, podatnik wystawił fakturę, obowiązek podatkowy powstaje z chwilą wystawienia faktury. W praktyce obrotu gospodarczego wystawienie faktury przez podatnika VAT następuje zazwyczaj łącznie z dostawą, tak więc jest to powszechny sposób powstania obowiązku podatkowego.
Jeżeli przed WDT otrzymano całość lub część ceny, obowiązek podatkowy powstaje z chwilą wystawienia potwierdzającej to faktury.
Zgodnie z rozporządzeniem ministra finansów z 25 maja 2005 r. w sprawie zwrotu podatku niektórym podatnikom, zaliczkowego zwrotu podatku, wystawiania faktur, sposobu ich przechowywania oraz listy towarów i usług, do których nie mają zastosowania zwolnienia od podatku od towarów i usług (DzU nr 95, poz. 798 ze zm.), jeżeli przed wydaniem towaru otrzymano część lub całość należności, w szczególności przedpłatę, zaliczkę, zadatek, ratę, fakturę wystawia się nie później niż siódmego dnia od tego zdarzenia. Dotyczy to również każdej kolejnej części należności pobranej przed wydaniem towaru.